随着基因组分析与肿瘤分子生物学分析的快速兴起,临床数据开始了其长期的爆炸性增长。现在,科研人员不仅需要有效地存储和解读大量临床数据,他们更加迫切需要与同行进行数据的交换和交流,更好地改善病人治疗效果并提高医疗水平。
最近,一项新的跨国大数据研究项目向人们进一步阐明了临床数据的大数据分析对于癌症研究与个性化治疗方法开发的重大意义。
“大数据一词的重点在于使用高性能计算机对大量数据的模式、趋势和关联做出解读。”该研究报告的作者,皇后大学癌症研究中心细胞生物学教授Mark Lawler博士解释说,“在医学术语中,大数据指病人的临床和基因数据,例如诊断检测和治疗的数据结果。”
Lawler博士同时担任全球基因和健康联盟(GA4GH) 癌症任务小组联合组长,全球基因和健康联盟是一家创立于2013年的公共机构,致力于病人的临床和基因数据负责任,自愿且安全的共享。
“随着相关技术的不断发展,癌症的分子生物学分析变得愈加高效且低廉,这便使得临床和基因数据开始呈指数增长。”该研究报告的共同作者,多伦多大学玛格丽特公主癌症中心教授Lillian Siu博士说,“全球医院、实验室以及科学基础设施拥有大量的癌症患者数据,目前,这些数据在绝大多数情况下都是以相对孤立的方式得到采集、分析以及储存,并没有得到充分的流通。这种对资源潜在价值的无视无疑是由数据共享缺失所导致的恶果,严重阻碍了科研与临床个性治疗的发展。”
GA4GH建立的初衷就是解决诸如此类的问题,通过在全球超过40个国家超过400家机构的科学家、临床医生、患者和其它生命科学从业者间建立合作为临床基因组研究人员提供更加有力的数据支持。GA4GH已经发表了相关报告,证实了病人数据共享对于医疗水平提高的重要意义。
“癌症是一种不可思议的复杂疾病,更可怕的是癌症还处于不断的变化之中,每位患者的肿瘤都有着各式各样的不同。”Lawler博士说,“在抗癌斗争中勇往直前的关键就是正确地认识癌症的发展过程。我们需要立足大局,对不同症状的癌症患者进行有效分类,对不同种类癌症患者相对分散的临床数据信息进行集成与分析。为了实现这一目的,我们必须改变先进这种数据孤立的状况,确保病人临床和基因数据的有效分享。”
Lawler博士同时不断向记者强调“建立癌症基因组分型网络的宏伟目标。”Lawler博士设想如果人们能建立一个用于科研的癌症数据库,帮助医生根据全球各个实验室的癌症基因组检测结果对他们的病人进行有效分类。这种在癌症基因组领域的合作将促进癌症个性化治疗的发展,提高药物针对不同病人的靶向性并最终改善癌症治疗效果。
Lawler博士及其同事的此项研究发表在最新的Nature Medicine上,题为“Facilitating a culture of responsible and effective sharing of cancer genome data.。”
“数据共享向我们提出诸多法律、技术以及伦理方面的问题,”Lawler博士说,“我们的研究报告毫无保留地将这些问题摆在了诸位同仁面前,同时,我们也提出了针对于这些问题可能的解决方案,以一种及时、负责且有效的方式进行数据的分析。我们希望全球癌症基因组领域的同仁们能够采纳我们的研究结果,采用一致的具体实施方式及标准,通过合作将癌症数据的价值最大化,从根本上提高医学与医疗水平。”